在商业特许经营领域，特许经营备案是一项重要的法律制度。它不仅关系到特许人的合法经营资格，也直接影响着加盟商的权益保障。然而，在实际操作中，部分加盟公司却未能按照规定进行备案，这种行为不仅违反了相关法律法规，也给加盟商带来了诸多不利影响。

根据《商业特许经营管理条例》的规定，特许人应当自首次订立特许经营合同之日起15日内向商务主管部门申请备案。备案的内容包括特许人的基本情况、拟订立特许经营合同的内容说明、特许经营合同样本等。这一制度的设计初衷是为了提高特许经营市场的透明度，保护加盟商的合法权益。

对于未进行特许经营备案的加盟公司而言，其面临的法律责任主要包括以下几个方面：首先，未备案的加盟公司将受到行政处罚。根据相关规定，商务主管部门有权责令其限期改正，并处以一定数额的罚款。若逾期仍未改正，则可能面临更加严厉的处罚措施，如吊销营业执照等。

其次，未备案的加盟公司可能承担民事赔偿责任。如果因其未备案而导致加盟商遭受损失，加盟商有权依据《合同法》等相关法律规定，要求加盟公司赔偿损失。特别是在加盟合同被认定为无效的情况下，加盟商不仅可以要求返还已支付的加盟费用，还可以主张相应的利息损失和其他合理费用。

再次，未备案的加盟公司可能涉及刑事犯罪。对于那些以非法占有为目的，虚构事实或隐瞒真相，骗取加盟商钱财的行为，一旦达到法定标准，就可能构成诈骗罪或其他相关罪名，从而面临刑事责任追究。

那么，加盟公司未备案对加盟商的具体影响又有哪些呢？一方面，未备案的加盟公司往往缺乏必要的经营资质和管理能力，难以提供有效的支持和服务。这使得加盟商在实际运营中面临诸多困难，如供应链不稳定、营销资源匮乏等，进而影响到加盟店的盈利水平。

另一方面，未备案的加盟公司可能存在较大的信用风险。由于缺乏监管，这些公司可能会随意变更合同条款、减少服务内容，甚至突然停止运营，导致加盟商陷入困境。而且，在发生纠纷时，加盟商维权的难度也会增加，因为未备案的加盟公司在法律程序上处于不利地位。

为了防范加盟公司未备案带来的风险，加盟商可以从以下几个方面入手：一是提前做好尽职调查，通过官方渠道核实加盟公司的备案情况；二是签订合同时明确约定双方的权利义务，特别是针对可能出现的违约情形设定合理的救济条款；三是积极参与行业组织或协会活动，获取更多关于特许经营的知识和信息，提高自身的风险识别能力。

总之，加盟公司未进行特许经营备案不仅是一种违法行为，也会对加盟商造成多方面的负面影响。因此，无论是从法律角度还是从实践角度来看，都应重视特许经营备案的重要性，确保特许经营市场的健康发展。